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天津免疫沉淀CoIP mass

来源: 发布时间:2024年09月19日

IP-WB(免疫沉淀-Western Blot)实验要点主要包括以下几个步骤:样品制备:确保样品新鲜且未经过多次冻融,以避免蛋白降解。裂解细胞或组织,获得含有目标蛋白及其相互作用伙伴的裂解液。免疫沉淀:选择特异性强的抗体,与目标蛋白结合形成复合物。将复合物与固相载体(如磁珠)结合,通过洗涤去除非特异性结合的杂质。电泳分离:将免疫沉淀得到的蛋白质复合物进行SDS-PAGE凝胶电泳,按照分子量大小分离蛋白质。Western Blot检测:将电泳后的蛋白质转移到固相膜上,利用特异性抗体检测目标蛋白或其相互作用伙伴的存在。通过显色反应可视化目标蛋白,确保特异性结合。结果分析:观察Western Blot结果,分析目标蛋白与其相互作用伙伴的相互作用情况,为后续研究提供依据。IP-WB技术结合免疫沉淀与Western Blot,高特异、高灵敏验证蛋白互作,支持功能研究与药物开发!天津免疫沉淀CoIP mass

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CoIP实验免疫沉淀方法如下:

将25µL(0.25mg)的Pierce蛋白A/G的磁珠加入1.5mL离心管中。

向磁珠中加入175µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液,轻微涡旋混匀。

将离心管放入磁力架中收集磁珠到离心管的一边。去除上清。

向离心管中加入1mL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液。颠倒离心管数次或轻微涡旋混匀1min。用磁力架收集磁珠。去除上清。

将抗原样品/抗体混合物加入盛有磁珠的离心管中,保持混匀室温下孵育1h。

用磁力架收集磁珠,除去未结合的样品,保存以备分析。

向离心管中加入500µL免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液,轻柔混匀。收集磁珠,弃上清。再重复洗两次。

向管中加入500µL超纯水,轻柔混匀。用磁力架收集磁珠,弃上清。

低pH洗脱:向离心管中加入100µL洗脱液。保持混匀在室温下孵育离心管10min。通过磁力分离磁珠,保留含有目的抗原的上清。每100µL洗出液中加入10µL中和液来中和低pH。备选洗脱方法:向离心管中加入100µL1X电泳上样缓冲液,将样品置于加热器中,96-100℃加热10min。通过磁力架分离磁珠,保留含有目的抗原的上清。

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Co-IP技术作为研究蛋白质相互作用的重要手段,其结果在多数情况下是可靠的。然而,该技术也存在一些潜在的限制和影响因素,需要研究人员予以注意。在实际应用中,由于细胞内蛋白质种类繁多且相互作用复杂,可能会出现非特异性结合或背景噪声,这要求研究者选择特异性强的抗体,并通过洗涤步骤去除杂质。此外,样品的纯度、抗体的质量和实验条件等也会对结果产生影响,因此,对抗体的选择和验证、样品的准备以及实验条件的控制都至关重要。为了进一步提高结果的准确性,研究人员通常会结合多种方法进行相互验证,如使用不同抗体或实验条件重复实验,或结合质谱技术来验证Co-IP的结果。这些措施共同增强了Co-IP技术结果的可靠性。

结合了抗体的磁珠或树脂(Beads)与样本裂解液孵育,通过”抗原-抗体“之间的免疫作用,诱饵蛋白被吸附在Beads上,与此同时,诱饵蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后,再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来,得到免疫共沉淀(Co-IP)产物。Co-IP产物既可以用WesternBlot检测已知蛋白,也可以用质谱鉴定未知蛋白。当没有合适的诱饵蛋白抗体时,还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白,利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait,经裂解后与anti-Flag珠子孵育,诱饵融合蛋白与Beads结合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再经洗涤、洗脱后,用WB或质谱检测。Co-IP(免疫共沉淀)技术广泛应用于生物学和医学研究领域。

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CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:

试验设计:尽量进行试验组别设计和进行生物学重复检测,提高后续验证的阳性率。常规过表达单组(AbIPvsIgGIP);动态互作组学(实验组vs对照组vsIg组)。根据目的设计适当的生物学重复。如果后续以CoIP-Mass数据进行互作组标准分析,则需要3-4组生物学重复;如果后续以寻找关键互作蛋白,进行机制深入研究,则建议1-2次生物学重复。经验显示单次重复假阳性率90%。

蛋白表达和细胞量:细胞用量要求大(2-10e7细胞量),建议不少于5e7(金标准:320g离心细胞量50μl,保障项目用量)。低表达蛋白,建议使用过表达组进行检测。蛋白表达可根据WB结果或初步根据数据库判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 IP-Mass实验流程:样品制备、免疫沉淀、洗脱、蛋白酶消化、质谱分析、数据分析,鉴定互作蛋白!天津免疫沉淀CoIP mass

Co-IP外源检测引入外源蛋白验证互作,敏感度高但需严控条件,结合内源检测更准确!天津免疫沉淀CoIP mass

CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势:优势:高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势:CoIP的蛋白库鱼龙混杂,包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白,非特异结合,残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白,其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白,导致CoIP-Mass假阳性高,CoIP-WB验证成功率低,导致研发进展反复跌宕,时间和经费成本占用较大,严重影响士气。其次,项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性,达到理想状态的CoIP-Mass较难,同时分析门槛较高。因此,该项目成功实施,比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。天津免疫沉淀CoIP mass

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